臺式掃描電子顯微鏡價格便宜，操作簡單，但由于可見光波長的限制，其放大倍數只能達到1000倍左右；傳統大型掃描電子顯微鏡有效放大倍數可以達到數萬倍，具有大景深，是當前材料科學、生物科學領域zui常用的表征手段之一，但其投資巨大，而且需要經過嚴格培訓的操作人員，使用不便。
臺式掃描電子顯微鏡價格相比其他的略微不一樣。是飛納電鏡系列中先進的產品，第四代 Phenom Pro 放大倍數提升為 130,000 倍，分辨率優于 14 nm，30 秒快速得到表面細節豐富的高質量圖像，是目前世界上分辨率zui高的臺式掃描電鏡。
臺式掃描電子顯微鏡的分辨率主要決定于樣品表面上電子束的直徑。放大倍數是顯像管上掃描幅度與樣品上掃描幅度之比，可從幾十倍連續地變化到幾十萬倍。掃描式電子顯微鏡不需要很薄的樣品；圖像有很強的立體感；能利用電子束與物質相互作用而產生的次級電子、吸收電子和X射線等信息分析物質成分。
